4.x 的 INDEX 位於 /usr/ports/INDEX，5.x 位於 /usr/ports/INDEX-5。 INDEX 是對照 ports 所有相依等資訊的對照表，若長期未更新的話，會導致ports 對照失敗。官方有定期更新 INDEX，如果 想自行更新的話，則： cd /usr/ports/ make fetchindex
更新 INDEX HTML
FreeBSD 提供了用網頁的方式來觀看 ports collection，即可使用 lynx, w3m, links 或其它可瀏覽網頁的程式來查閱。制作全部 ports collection 的方式如下： cd /usr/ports/ make readmes 如果是僅須要做目前目錄下的資訊，或單一更新某一分類下的資訊，如 /usr/ports/ftp/ 的話，則： cd /usr/ports/ftp/ make readme 則僅會更新 /usr/ports/ftp/ 這個目錄的資訊，其上與其下的目錄皆不會更動到。 執行成功後，會在相對應的目錄下產生 README.html 的檔案。
cd /usr/src/ make update cd /usr/src/share/mk make install
以關鍵字在ports尋找軟件
如果要從全部的 ports collection 中找尋與關鍵字 "ldap" 有關的 ports，則： cd /usr/ports/ make search key=ldap | grep ^Path
如果只要從與 ftp 相關的 ports 下找尋與關鍵字 "ldap" 有關的 ports，則： cd /usr/ports/ftp/ make search key=ldap | grep ^Path 還有另一個用法，方法只是將 key 換成 name 。如果已經知道要搜尋 ports 的名稱，或只想找名稱相關的關鍵字 "ldap"， 則： cd /usr/ports/ make search name=ldap | grep ^Path
如果只要從 ftp 相關的 ports 下找尋名稱與關鍵字 "ldap" 有關的 ports，則：
cd /usr/ports/ftp/ make search name=ldap | grep ^Path
安裝一個新的 port
如果系統上未安裝此軟體，則可以選擇安裝一個新的 port。以 editors/joe 為例的話，則： cd /usr/ports/editors/joe/ make install 如此會在系統上安裝一個新的 joe 軟體。如果需要在安裝完成後，一并清除編輯時期所留下來的暫存目錄，則： cd /usr/ports/editors/joe/ make clean
cd /usr/ports/sysutils/portupgrade/ make -DNOPORTDOCS install 和make NOPORTDOCS=yes install 亦同那麼安裝此 ports 時，會將 NOPORTDOCS 所對應的相關叁數指定進去。有時候設定較人性化的 ports 會在安裝前提供叁數供選擇，但是其實大部份的ports 都沒有提供，因此必須自行去搜尋可編 譯的叁數，在此我提供的方式如下：
cd /usr/ports/sysutils/portupgrade/ grep defined Makefile 如此幾乎可以知道所有提供的可編譯叁數，雖然有時會多出一些不相干的資料，不會這個確實是一個不錯可叁考的方式。
安裝 ports 前查詢所需依賴/相關的套件
在安裝 ports 前，可以查詢所需依賴/相關的套件。以 mail/p5-Mail-SpamAssassin 為例的話，則： cd /usr/ports/mail/p5-Mail-SpamAssassin/ make all-depends-list #顯示所有相關的套件 make pretty-print-build-depends-list #顯示編譯期間所需要的套件 make pretty-print-run-depends-list #顯示此套件要執行時所需要的套件
cd /usr/ports/sysutils/portupgrade/ make DEPENDS_TARGET=package package 如此會在對所有 portupgrade 所相依賴的 ports 一并打包，也包括自己本身。
對一個已經安裝的 port 打包
如果安裝好一個套軟，事前并未打包，事後想打包的話，則： 以 editors/joe 為例的話
cd /var/db/pkg/ pkg_create -b joe-{版本號} 會將已安裝的 port 打包起來，放在 /var/db/pkg/ 目錄下。
清理 ports 編輯期間所產生的暫存資料
在編輯 port 的時候，會有編輯期間所需要的工作目錄(work)，因此通常安裝好一個套件後，會清除此暫存目錄，以節省系 統磁碟空間。以 editors/joe 為例的話，則：
cd /usr/ports/editors/joe/ make clean
如果是希望清除所有 ports 的暫存目錄，則： cd /usr/ports/ make clean
如果是希望清除全部 ftp 下所有的暫存目錄，則： cd /usr/ports/ftp/ make clean
清理 ports 編輯期間所產生的暫存資料，以及其相對應的源碼包
make clean，僅只是清除編輯期間所需要的工作目錄(work)，并沒有將編譯ports 時一并下載的 源碼包 刪除(相對應之 源碼包 預設會存放在 /usr/ports/distfiles/)，如果欲把 源碼包 一并刪除，以 editors/joe 為例的話，則： cd /usr/ports/editors/joe/ make distclean make distclean 的步驟包含了 make clean 的功能，也就是說除了會刪除源碼包 外，還會一并清除編輯期間所產生的工作目錄。
如果是希望清除所有 ports 的暫存目錄，及源碼包 ，則： cd /usr/ports/ make distclean
如果是希望清除全部 ftp 下所有的暫存目錄，及 源碼包，則： cd /usr/ports/ftp/ make distclean
移除已安裝的 ports 以 editors/joe 為例的話，則： cd /usr/ports/editors/joe/ make deinstall 或是使用 pkg_delete cd /var/db/pkg/ pkg_delete joe-{version} 有時候套件之間的相依性會導致無法直接移除，如果要強制移除的話，則： cd /var/db/pkg/ pkg_delete -f joe-{version}但很有可能會導致其它的套件執行起來出現問題。
一并移除所相依的 ports
以 sysutils/portupgrade 為例的話，則： cd /usr/ports/sysutils/portupgrade/ make deinstall-depends 執行此步驟前，請注意是否會移除應該保護的套件。 或是使用 pkg_delete cd /var/db/pkg/ pkg_delete -r portupgrade-{version} 重新安裝已安裝過的 ports 重新安裝的前提是，之前有安裝過或目前已安裝。以 editors/joe 為例的話， 則： cd /usr/ports/editors/joe/ make deinstall make clean make install 或 make reinstall
